Das Team entdeckt, dass Kates Mörder Ari, ein gesuchter Terrorist, eine Verbindung zu der neuen NCIS-Agentin Ziva David haben könnte.

Unterdessen stellt sich Jennifer Shepard als neue Direktorin des NCIS vor.

Ducky wird entführt und es kommt zum Showdown zwischen Gibbs und Ari. Tony und Ziva versuchen, in der Rolle von zwei ermordeten Auftragskillern herauszufinden, wer die Auftraggeber waren.

Während der Ermittlung verschwinden beide spurlos.